2010年起，李奎教授团队联合国内优势单位组建“蓝思猪配套系育种协作组”，旨在通过分子标记辅助育种和全基因组辅助育种等生物育种新技术，在主流商用引进猪种的基础上，培育出高效优质型种猪。团队先后从英国引进英系大白原种猪，从美国引进美系大白猪、美系长白猪、美系杜洛克猪和美系巴克夏猪，建立了生产规模超过2000头的原种猪繁育群体，开展了蓝思猪配套系选育工作，为进一步加快选育进展，团队研发了一系列针对蓝思猪配套系的种猪育种分析软件和数据库系统，集成分子标记辅助育种技术和基因组育种技术，将生长、繁殖和免疫基因相关的一系列分子标记专利，应用于蓝思猪配套系的选育工作中，实现种猪的早期精准选育，显著提高了育种效率，缩短了育种时间，提高了育种的准确性。

据李奎教授介绍，蓝思猪配套系的饲料效率等主要经济性状较引进原种猪有显著提高，并且肉质风味优良，综合生产性能位居国际前列。蓝思猪配套系商品猪抗病力强、易饲养、生长较快、整齐度高、抗逆性强，其优良的肉品质符合山东半岛沿海地区人民对“鲜香味美”饮食习惯，可以满足当地乃至国内外市场需求。未来蓝思猪配套系育种协作组在保持其高效的生产效率基础上，会适当增加配套系的数量，并持续进行选育，稳步提升肉质等性状改良。加强推广应用，稳步提升华系种猪市场占有率。

奇米影视999澎湃新闻从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉，近日，由中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）李奎教授团队联合山东蓝思种业股份有限公司、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、日照市畜牧兽医管理服务中心、山东省农业科学院畜牧兽医研究所、山东农业大学、扬州大学、青岛农业大学、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所共8家国内优势单位自主培育的高效优质蓝思猪配套系通过国家畜禽遗传资源委员会审定。蓝思猪配套系的选育成功，打破了种猪高度依赖国外的局面，标志着我国种猪拥有了自主知识产权的“国产芯”，也为我国大量引进猪种的改良提升提供了重要技术和宝贵经验。

我国是世界生猪生产与猪肉消费第一大国，猪肉产量和消费量分别占世界总量的44%、46%，但用于商业化生产的猪种90%以上依赖进口，我国自主培育的高效优质型种猪严重缺乏。培育出生产性能、育种效率具有国际竞争力的国产化种猪，打破国外对“猪芯片”的垄断，是突破生猪种业“卡脖子”问题的关键。

历经14年的科研攻关，团队成功培育出3个蓝思猪专门化品系，分别是蓝思I系、蓝思II系和蓝思III系。经第三方权威机构测定，蓝思猪配套系商品猪料重比、达100kg日龄、胴体瘦肉率等主要经济性状均较引进原种有显著提高，并且抗病性能显著提升，肉质风味优良，有望替代杜洛克、长白、大白等现有进口种猪品种，成为主流的商业化猪品种。